Aaltonen, Lauri: Kasvaingenetiikan tutkimuksen huippuyksikkö
Katajisto, Pekka: Kantasolumetabolian huippuyksikkö (Viikki/HiLIFE)
Ripatti, Samuli: Kompleksitautien genetiikan huippuyksikkö - Geneettisistä löydöksistä henkilökohtaiseen lääketieteeseen
Alitalo, Kari: Translationaalisen syöpäbiologian huippuyksikkö
Ikonen, Elina: Kalvotutkimuksen huippuyksikkö: lipidi-proteiini-vuorovaikutuksista biologisiin toimintoihin
Jacobs, Howard: Mitokondrioiden, aineenvaihdunnan ja sairauksien tutkimuksen huippuyksikkö (FinMIT), Tampereen yliopisto
Aaltonen, Lauri: Syöpägenetiikan tutkimuksen huippuyksikkö
Knip, Mikael: Molekylaarisen systeemi-immunologian ja fysiologian huippuyksikkö
Tiedekunnan tutkimusohjelmayksikön tutkimusohjelmat valitaan ulkopuolisen arvioinnin perusteella kuudeksi vuodeksi kerrallaan. Arviointeja varten on nimitetty kansainvälinen tieteellinen neuvosto (Scientific Advisory Board, SAB), jonka kaikki jäsenet ovat omilla aloillaan tunnettuja kansainvälisiä tutkijoita.
Lääketieteellinen tiedekunta on kansallisesti ja kansainvälisesti arvostettu koulutus- ja tutkimusyksikkö sekä yhteistyökumppani, joka ottaa toiminnassaan huomioon yhteiskunnalliset tarpeet ja muuttuvan tautikirjon. Tiedekunnan toiminnan laatua ylläpidetään, arvioidaan ja kehitetään kaikki osa-alueet kattavalla laadunvarmistus-järjestelmällä, joka perustuu Helsingin yliopiston laatupolitiikkaan. Tiedekunta kouluttaa useita terveydenhuollon ammattiryhmien asiantuntijoita, tavoitteena mahdollisimman korkea hoidon ja diagnostiikan laatu.