Eläinlääketieteellinen tiedekunta koordinoi Kliinisen eläinlääketieteen tohtoriohjelmaa (CVM) ja Ruokaketjun ja terveyden tohtoriohjelmaa (FoodHealth). Ohjelmakohtaiset hakuohjeet ja hakuajat löytyvät kyseisen tohtoriohjelman kotisivulta.
Eläinlääketieteellisen tiedekunnan tohtorikoulutettavat voivat kuulua yhteen seuraavista kuudesta tohtoriohjelmasta: