Aleksanteri-instituutin tutkimustoiminta keskittyy kuudelle painopistealueelle, joiden valinta perustuu sekä kohdemaiden tutkimustarpeeseen ja analyysiin niiden tulevaisuuden haasteista että instituutin piirissä olevan asiantuntemuksen hyödyntämiseen. Jokaista painopistealuetta lähestytään laajempien monitieteisten tutkimusohjelmien kautta, jotka muodostuvat yhdestä tai useammasta tutkimusprojektista.
Aleksanteri-instituutilla on myös oma kansainvälinen maisteriohjelma Russian, Eurasian, and Eastern European Studies.
Aleksanteri-instituutin oma verkkosivusto löytyy osoitteesta helsinki.fi/aleksanteri.